MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL04

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014827	ATA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133711
2	NC_014827	CTT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133711
3	NC_014827	A	7	7	135	141	100 %	0 %	0 %	0 %	317133711
4	NC_014827	AGA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133711
5	NC_014827	AT	3	6	219	224	50 %	50 %	0 %	0 %	317133711
6	NC_014827	GTT	2	6	260	265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133711
7	NC_014827	A	6	6	294	299	100 %	0 %	0 %	0 %	317133711
8	NC_014827	GCAGA	2	10	393	402	40 %	0 %	40 %	20 %	317133712
9	NC_014827	GAT	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133712
10	NC_014827	AAGC	2	8	545	552	50 %	0 %	25 %	25 %	317133712
11	NC_014827	A	6	6	615	620	100 %	0 %	0 %	0 %	317133712
12	NC_014827	TAA	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133712
13	NC_014827	GCA	2	6	666	671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014827	TCTTTT	2	12	684	695	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014827	T	6	6	692	697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014827	ATT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133713
17	NC_014827	TCAT	2	8	732	739	25 %	50 %	0 %	25 %	317133713
18	NC_014827	GCC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133713
19	NC_014827	CAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133713
20	NC_014827	CT	3	6	818	823	0 %	50 %	0 %	50 %	317133713
21	NC_014827	ACCGC	2	10	840	849	20 %	0 %	20 %	60 %	317133713
22	NC_014827	T	7	7	875	881	0 %	100 %	0 %	0 %	317133713
23	NC_014827	CAGCT	2	10	950	959	20 %	20 %	20 %	40 %	317133713
24	NC_014827	TTC	2	6	965	970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133713
25	NC_014827	TGTA	2	8	1099	1106	25 %	50 %	25 %	0 %	317133714
26	NC_014827	TC	3	6	1110	1115	0 %	50 %	0 %	50 %	317133714
27	NC_014827	ATA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133714
28	NC_014827	CTT	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
29	NC_014827	TTC	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
30	NC_014827	GT	3	6	1228	1233	0 %	50 %	50 %	0 %	317133714
31	NC_014827	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
32	NC_014827	TTA	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
33	NC_014827	ATAA	2	8	1314	1321	75 %	25 %	0 %	0 %	317133714
34	NC_014827	TCA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133714
35	NC_014827	AT	3	6	1416	1421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014827	CAC	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014827	GCA	2	6	1652	1657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014827	GCA	2	6	1684	1689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014827	ACT	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014827	GCG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014827	AGCCG	2	10	1909	1918	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014827	CAAG	2	8	1959	1966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014827	TG	4	8	1970	1977	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014827	CTA	2	6	2030	2035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014827	GGC	2	6	2053	2058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014827	AGA	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014827	AAGA	2	8	2185	2192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014827	GCT	2	6	2221	2226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014827	TGC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014827	GCA	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014827	GAA	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014827	GA	4	8	2387	2394	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014827	AAT	2	6	2395	2400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014827	AGC	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014827	CAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014827	CAG	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014827	AAC	2	6	2495	2500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014827	GAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014827	GAAC	2	8	2569	2576	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014827	AG	3	6	2580	2585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014827	GAAC	2	8	2593	2600	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014827	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014827	A	6	6	2710	2715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014827	AAC	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014827	CAG	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014827	AAG	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014827	AGC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014827	CAGACA	2	12	2840	2851	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014827	GCA	2	6	2887	2892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014827	AGC	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014827	AGC	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014827	GAA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014827	GAA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014827	GCAAG	2	10	2969	2978	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014827	AGC	2	6	2979	2984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014827	AGC	2	6	3040	3045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014827	GCA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014827	AGA	2	6	3073	3078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014827	GCG	2	6	3080	3085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014827	ATA	2	6	3086	3091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014827	AGC	3	9	3117	3125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014827	ATC	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014827	TGGAA	2	10	3177	3186	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014827	GCA	2	6	3275	3280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014827	TTA	2	6	3414	3419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014827	TGT	3	9	3430	3438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014827	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014827	TG	3	6	3547	3552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014827	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014827	TGA	2	6	3588	3593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014827	GCA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014827	GA	3	6	3643	3648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014827	CA	3	6	3691	3696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014827	TAA	2	6	3712	3717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014827	CA	3	6	3749	3754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014827	A	7	7	3899	3905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014827	A	7	7	3909	3915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014827	A	7	7	3976	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014827	TGAGCG	2	12	4019	4030	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014827	TG	3	6	4031	4036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014827	TTC	2	6	4043	4048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014827	TTCTT	2	10	4059	4068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014827	TCT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014827	AAGAA	2	10	4077	4086	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014827	GAAA	2	8	4087	4094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014827	ATG	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014827	GCT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133715
108	NC_014827	CGC	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133715
109	NC_014827	GCA	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
110	NC_014827	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
111	NC_014827	TGA	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
112	NC_014827	GCA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
113	NC_014827	CGG	2	6	4827	4832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133715
114	NC_014827	GCTAT	2	10	4859	4868	20 %	40 %	20 %	20 %	317133715
115	NC_014827	CCGT	2	8	4896	4903	0 %	25 %	25 %	50 %	317133715
116	NC_014827	GTT	3	9	4966	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133715
117	NC_014827	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
118	NC_014827	AAG	3	9	5017	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133715
119	NC_014827	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
120	NC_014827	A	6	6	5146	5151	100 %	0 %	0 %	0 %	317133715
121	NC_014827	GAT	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
122	NC_014827	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133715
123	NC_014827	TAA	2	6	5319	5324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133715
124	NC_014827	AGC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
125	NC_014827	GCA	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
126	NC_014827	TGG	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
127	NC_014827	A	6	6	5622	5627	100 %	0 %	0 %	0 %	317133716
128	NC_014827	GTGG	2	8	5635	5642	0 %	25 %	75 %	0 %	317133716
129	NC_014827	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	317133716
130	NC_014827	GAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
131	NC_014827	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
132	NC_014827	ATG	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133716
133	NC_014827	ATA	2	6	5950	5955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133716
134	NC_014827	A	6	6	5955	5960	100 %	0 %	0 %	0 %	317133716
135	NC_014827	TTA	2	6	5961	5966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133716
136	NC_014827	CAG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
137	NC_014827	AGC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
138	NC_014827	TGG	2	6	6066	6071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133716
139	NC_014827	CCGA	2	8	6090	6097	25 %	0 %	25 %	50 %	317133716
140	NC_014827	A	6	6	6115	6120	100 %	0 %	0 %	0 %	317133717
141	NC_014827	GAA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133717
142	NC_014827	CTG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133717
143	NC_014827	TGG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133717
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145	NC_014827	AGCCTG	2	12	6255	6266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	317133717
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163	NC_014827	T	6	6	6812	6817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014827	AT	3	6	6853	6858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014827	TAC	2	6	6869	6874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_014827	AT	3	6	6934	6939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014827	T	7	7	6969	6975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_014827	ATTA	2	8	7390	7397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.